MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11

Total Repeats: 54578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008527	T	6	6	1	6	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008527	TAA	2	6	28	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008527	TGG	2	6	44	49	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008527	CTTT	2	8	54	61	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008527	CAA	2	6	117	122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008527	T	7	7	227	233	0 %	100 %	0 %	0 %	116510844
7	NC_008527	TGTC	2	8	253	260	0 %	50 %	25 %	25 %	116510844
8	NC_008527	CTTG	2	8	281	288	0 %	50 %	25 %	25 %	116510844
9	NC_008527	A	6	6	300	305	100 %	0 %	0 %	0 %	116510844
10	NC_008527	ATT	2	6	307	312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116510844
11	NC_008527	A	6	6	315	320	100 %	0 %	0 %	0 %	116510844
12	NC_008527	GAT	2	6	365	370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510844
13	NC_008527	ATG	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510844
14	NC_008527	CGT	2	6	417	422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116510844
15	NC_008527	AATC	2	8	429	436	50 %	25 %	0 %	25 %	116510844
16	NC_008527	TGA	2	6	443	448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510844
17	NC_008527	TTGCTG	2	12	562	573	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116510844
18	NC_008527	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116510844
19	NC_008527	ATGC	2	8	642	649	25 %	25 %	25 %	25 %	116510844
20	NC_008527	ACTT	2	8	787	794	25 %	50 %	0 %	25 %	116510844
21	NC_008527	GAT	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510844
22	NC_008527	AAG	2	6	826	831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510844
23	NC_008527	ACT	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116510844
24	NC_008527	A	6	6	1199	1204	100 %	0 %	0 %	0 %	116510844
25	NC_008527	CAA	2	6	1212	1217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116510844
26	NC_008527	A	8	8	1238	1245	100 %	0 %	0 %	0 %	116510844
27	NC_008527	ATT	2	6	1264	1269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116510844
28	NC_008527	ACA	2	6	1413	1418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116510844
29	NC_008527	CTA	3	9	1616	1624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008527	TAT	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008527	TAA	2	6	1682	1687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116510845
32	NC_008527	TTGAAG	2	12	1771	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510845
33	NC_008527	TCAA	2	8	1821	1828	50 %	25 %	0 %	25 %	116510845
34	NC_008527	ATA	2	6	1846	1851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116510845
35	NC_008527	TTA	2	6	1890	1895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116510845
36	NC_008527	GCT	2	6	1899	1904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116510845
37	NC_008527	GTA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510845
38	NC_008527	TTG	2	6	1977	1982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116510845
39	NC_008527	TTC	2	6	2060	2065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116510845
40	NC_008527	TGAAAG	2	12	2074	2085	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116510845
41	NC_008527	GAAA	2	8	2090	2097	75 %	0 %	25 %	0 %	116510845
42	NC_008527	AGA	2	6	2240	2245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510845
43	NC_008527	ATG	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510845
44	NC_008527	AAG	2	6	2320	2325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510845
45	NC_008527	TCA	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116510845
46	NC_008527	TTA	2	6	2381	2386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116510845
47	NC_008527	TTGA	2	8	2394	2401	25 %	50 %	25 %	0 %	116510845
48	NC_008527	TGC	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116510845
49	NC_008527	AAT	2	6	2516	2521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116510845
50	NC_008527	CAAC	2	8	2524	2531	50 %	0 %	0 %	50 %	116510845
51	NC_008527	GAA	2	6	2607	2612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510845
52	NC_008527	AAG	2	6	2629	2634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510845
53	NC_008527	TATC	2	8	2644	2651	25 %	50 %	0 %	25 %	116510845
54	NC_008527	TGAT	2	8	2671	2678	25 %	50 %	25 %	0 %	116510845
55	NC_008527	GAA	2	6	2760	2765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510845
56	NC_008527	GTAC	2	8	2793	2800	25 %	25 %	25 %	25 %	116510845
57	NC_008527	AATT	2	8	2802	2809	50 %	50 %	0 %	0 %	116510845
58	NC_008527	T	6	6	2907	2912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008527	TA	3	6	2923	2928	50 %	50 %	0 %	0 %	116510846
60	NC_008527	ATT	2	6	2957	2962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116510846
61	NC_008527	GAA	2	6	2976	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510846
62	NC_008527	A	7	7	2986	2992	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
63	NC_008527	TAC	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116510846
64	NC_008527	CTT	2	6	3016	3021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116510846
65	NC_008527	GAAA	2	8	3041	3048	75 %	0 %	25 %	0 %	116510846
66	NC_008527	CAG	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116510846
67	NC_008527	T	6	6	3085	3090	0 %	100 %	0 %	0 %	116510846
68	NC_008527	AAC	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116510846
69	NC_008527	TTA	2	6	3122	3127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116510846
70	NC_008527	CAA	2	6	3148	3153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116510846
71	NC_008527	A	6	6	3216	3221	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
72	NC_008527	A	7	7	3357	3363	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
73	NC_008527	AAC	2	6	3368	3373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116510846
74	NC_008527	CAG	2	6	3459	3464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116510846
75	NC_008527	GAA	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510846
76	NC_008527	TTAT	2	8	3522	3529	25 %	75 %	0 %	0 %	116510846
77	NC_008527	TGT	2	6	3560	3565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116510846
78	NC_008527	TGA	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
79	NC_008527	GAT	2	6	3632	3637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
80	NC_008527	AAAT	2	8	3650	3657	75 %	25 %	0 %	0 %	116510846
81	NC_008527	CTT	2	6	3682	3687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116510846
82	NC_008527	TTA	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116510846
83	NC_008527	TGA	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
84	NC_008527	A	6	6	3760	3765	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
85	NC_008527	AGA	2	6	3779	3784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510846
86	NC_008527	A	6	6	3859	3864	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
87	NC_008527	T	6	6	3878	3883	0 %	100 %	0 %	0 %	116510846
88	NC_008527	CAG	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116510846
89	NC_008527	GAAA	2	8	3935	3942	75 %	0 %	25 %	0 %	116510846
90	NC_008527	AAG	2	6	3979	3984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510846
91	NC_008527	T	6	6	4014	4019	0 %	100 %	0 %	0 %	116510846
92	NC_008527	A	8	8	4038	4045	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
93	NC_008527	GAT	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
94	NC_008527	AAAGT	2	10	4081	4090	60 %	20 %	20 %	0 %	116510846
95	NC_008527	TGA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
96	NC_008527	AGA	2	6	4181	4186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510846
97	NC_008527	ACT	2	6	4241	4246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116510846
98	NC_008527	AAT	2	6	4281	4286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116510846
99	NC_008527	A	6	6	4291	4296	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
100	NC_008527	A	7	7	4301	4307	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
101	NC_008527	TTC	2	6	4458	4463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116510846
102	NC_008527	T	6	6	4468	4473	0 %	100 %	0 %	0 %	116510846
103	NC_008527	TGA	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
104	NC_008527	ATGTTG	2	12	4558	4569	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116510846
105	NC_008527	TTG	2	6	4591	4596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116510846
106	NC_008527	TGA	2	6	4715	4720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
107	NC_008527	A	7	7	4759	4765	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
108	NC_008527	GTCTT	2	10	4776	4785	0 %	60 %	20 %	20 %	116510846
109	NC_008527	AG	3	6	4802	4807	50 %	0 %	50 %	0 %	116510846
110	NC_008527	ATT	2	6	4871	4876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116510846
111	NC_008527	TGA	2	6	4889	4894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
112	NC_008527	A	6	6	4894	4899	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
113	NC_008527	A	6	6	4906	4911	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
114	NC_008527	T	6	6	5035	5040	0 %	100 %	0 %	0 %	116510846
115	NC_008527	A	6	6	5086	5091	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
116	NC_008527	AC	3	6	5140	5145	50 %	0 %	0 %	50 %	116510846
117	NC_008527	TTG	2	6	5281	5286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116510846
118	NC_008527	T	6	6	5291	5296	0 %	100 %	0 %	0 %	116510846
119	NC_008527	GACT	2	8	5327	5334	25 %	25 %	25 %	25 %	116510846
120	NC_008527	CAG	2	6	5338	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116510846
121	NC_008527	TGA	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
122	NC_008527	T	7	7	5368	5374	0 %	100 %	0 %	0 %	116510846
123	NC_008527	AAG	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510846
124	NC_008527	AGA	2	6	5447	5452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510846
125	NC_008527	TGA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
126	NC_008527	AGT	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
127	NC_008527	TGA	2	6	5570	5575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
128	NC_008527	TATT	2	8	5576	5583	25 %	75 %	0 %	0 %	116510846
129	NC_008527	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510846
130	NC_008527	TCAT	2	8	5657	5664	25 %	50 %	0 %	25 %	116510846
131	NC_008527	ATG	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
132	NC_008527	A	6	6	5746	5751	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
133	NC_008527	TTTA	2	8	5764	5771	25 %	75 %	0 %	0 %	116510846
134	NC_008527	AACC	2	8	5781	5788	50 %	0 %	0 %	50 %	116510846
135	NC_008527	ATG	2	6	5854	5859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510846
136	NC_008527	AGA	2	6	5870	5875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510846
137	NC_008527	A	6	6	5915	5920	100 %	0 %	0 %	0 %	116510846
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